Цветы
У василька синего краевые цветки собраны в корзинках, воронковидные, синего или голубого цвета, внутренние цветки - трубчатые красно- или сине-фиолетовые, либо беловатые по оттенку цвета.
Плоды
Плод - обратнояйцевидная, свинцово-серая или коричнево-лиловая семянка с летучкой, длиной 2,75-4,5 мм, шириной 1,75-2,25 мм, толщиной 1-1,75мм. Масса 1000 семянок около 3-4г. Минимальная температура прорастания семян +3-5°С. Плодоносит василек синий с июля до октября. Свежесозревшие или недозревшие семена не теряют всхожесть. Максимальная плодовитость от экземпляра 6700 семянок.
Стебель
Стебель прямой, ветвистый, опушенный, высота 25-100см.
Листья
Семядоли длиной 10-16 мм, шириной 6-8 мм, обратнояйцевидные. Первые листья длиной 3-4 см, шириной 8-12мм, узкообратнояйцевидные, редкозубчатые. Листья и черешки опушенные. Эпикотиль у василька синего не развит. Гипокотиль бледно-зеленого цвета.
